Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCATO75600 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCATO75600 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCATO75600 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCATO75600 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCATO75600 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCATO75600 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCATO75600 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms