Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KIAA0556O60303 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIAA0556O60303 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms