Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms