Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GGTLC3B5MD39 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GGTLC3B5MD39 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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