Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms