Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms