Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IGSF9BQ9UPX0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IGSF9BQ9UPX0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IGSF9BQ9UPX0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms