Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD4AQ9UPU9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms