Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms