Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GDE1Q9NZC3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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