Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG3Q9NT62 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms