Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms