Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms