Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms