Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBL7Q96S82 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBL7Q96S82 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms