Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB3IPQ96QF0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms