Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEDD4LQ96PU5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms