Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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