Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms