Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHMTQ93088 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms