Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RYBPQ8N488 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RYBPQ8N488 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms