Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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