Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC103Q8IW40 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC103Q8IW40 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms