Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP13Q86W25 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP13Q86W25 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms