Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT9Q86SS6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms