Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD1Q6UXZ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms