Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSSK4Q6SA08 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TSSK4Q6SA08 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms