Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC27A4Q6P1M0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms