Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms