Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GKAP1Q5VSY0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GKAP1Q5VSY0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GKAP1Q5VSY0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GKAP1Q5VSY0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms