Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C6orf141Q5SZD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms