Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MS4A13Q5J8X5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MS4A13Q5J8X5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms