Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP28Q4G0W2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DUSP28Q4G0W2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms