Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MICAQ29983 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MICAQ29983 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MICAQ29983 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms