Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCOA1Q15788 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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