Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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UBE3CQ15386 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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UBE3CQ15386 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE3CQ15386 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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UBE3CQ15386 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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