Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ODF1Q14990 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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ODF1Q14990 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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