Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMC1AQ14683 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms