Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAMK2BQ13554 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAMK2BQ13554 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms