Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BFSP2Q13515 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BFSP2Q13515 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms