Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MKRN3Q13064 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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