Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPAQ06546 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms