Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OC90Q02509 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OC90Q02509 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OC90Q02509 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms