Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1BQ00975 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1BQ00975 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms