Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2NP61088 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms