Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms