Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP2P53365 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms