Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CX3CR1P49238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CX3CR1P49238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms