Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGIRP43119 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms