Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRPPRCP42704 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRPPRCP42704 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms